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<p>Les scientifiques ont découvert les « empreintes digitales » de virus mystérieux cachés dans un ancien groupe de microbes qui ont peut-être contribué à alimenter l&rsquo;essor de toute vie complexe sur Terre : des champignons aux plantes en passant par les humains. </p>
<p>Ces microbes &#8211; connus sous le nom d&rsquo;Asgard archaea d&rsquo;après la demeure des dieux dans la mythologie nordique &#8211; se cachent dans les sédiments glaciaux au fond de l&rsquo;océan et dans les sources chaudes bouillantes, et existaient sur Terre avant le premier <u>eucaryote</u> cellules, qui portent leur <u>ADN</u> à l&rsquo;intérieur d&rsquo;un noyau. En infectant les archées d&rsquo;Asgard, <u>virus</u> peut avoir influencé la façon dont ces formes de vie sont apparues pour la première fois, et peut même avoir donné naissance à certains des premiers précurseurs du noyau, <a rel="nofollow noopener" href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32961211/" target="_blank" data-url="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32961211/"><u>certains scientifiques émettent l&rsquo;hypothèse</u><span class="sr-only"> (s&rsquo;ouvre dans un nouvel onglet)</span></a>. Mais jusqu&rsquo;à présent, aucun virus infectant Asgard n&rsquo;avait été découvert. </p>
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<p>Maintenant, dans un trio d&rsquo;études publiées lundi 27 juin dans la revue Nature Microbiology, les scientifiques ont identifié un grand nombre de virus qui peuvent infecter les anciennes archées. </p>
<p>« Ce sont les premières études portant sur les virus archéens d&rsquo;Asgard ; on ne savait rien auparavant », a déclaré Susanne Erdmann, chef de groupe du groupe de recherche sur la virologie des archéens à l&rsquo;Institut Max Planck de microbiologie marine à Brême, en Allemagne, qui n&rsquo;a pas participé aux études. . À l&rsquo;avenir, cette ligne de recherche pourrait révéler si et comment des virus étaient impliqués dans l&rsquo;émergence de cellules eucaryotes sur Terre, a déclaré Erdmann à Live Science dans un e-mail.</p>
<p><strong>Lié: </strong><u><strong>Des scientifiques découvrent des virus qui gouvernent secrètement les océans du monde</strong></u> </p>
<h2 id="dusting-for-viral-apos-fingerprints-apos-xa0">Dépoussiérage pour les « empreintes digitales » virales </h2>
<p>Dans la nouvelle recherche, les scientifiques ont recherché des preuves d&rsquo;infection virale intégrées dans l&rsquo;ADN des archées d&rsquo;Asgard. Cette preuve intégrée se présente sous la forme de courts extraits d&rsquo;ADN viral, appelés « <u>CRISPR</u> entretoises. » </p>
<p>La plupart des gens qui entendent le terme CRISPR pensent au <u>célèbre outil d&rsquo;édition de gènes</u> qui permet aux scientifiques de manipuler facilement des séquences génétiques, a déclaré Ian Rambo, ancien candidat au doctorat à l&rsquo;Université du Texas à l&rsquo;Austin Marine Science Institute et premier auteur de l&rsquo;un des <u>Microbiologie naturelle</u><span class="sr-only"> (s&rsquo;ouvre dans un nouvel onglet)</span> études. Cependant, cet outil d&rsquo;édition de gènes a été adapté à l&rsquo;origine des mécanismes de défense naturels de <u>bactéries</u> et les archées, a-t-il déclaré à Live Science.</p>
<p>L&rsquo;acronyme « CRISPR » signifie « grappes de courtes répétitions palindromiques régulièrement espacées » et fait référence à une région d&rsquo;ADN composée de séquences courtes et répétées avec des « espaceurs » pris en sandwich entre chaque répétition. Les bactéries et les archées balaient ces espaceurs des virus qui les infectent, et ainsi, les cellules maintiennent une banque de mémoire d&rsquo;ADN viral qui les aide à reconnaître les virus, s&rsquo;ils attaquent à nouveau. « C&rsquo;est un système immunitaire adaptatif qui se souvient de ces infections précédentes », a déclaré Rambo, qui est maintenant chercheur postdoctoral au service de recherche agricole de l&rsquo;USDA.</p>
<p>Rambo et ses collègues ont chassé dans le bassin de Guaymas dans le golfe de Californie – la masse d&rsquo;eau entre la Basse-Californie et le Mexique continental – pour de tels espaceurs d&rsquo;ADN dans des spécimens d&rsquo;archées Asgard prélevés dans des sédiments près des évents hydrothermaux, à environ 1,25 miles (2 kilomètres) sous le surface de l&rsquo;eau. L&rsquo;équipe a fait correspondre les espaceurs qu&rsquo;ils ont trouvés à de plus longues étendues d&rsquo;ADN viral recueillies dans l&rsquo;environnement des grands fonds marins. </p>
<p><strong>Lié: </strong><u><strong>Les virus sont-ils vivants ?</strong></u></p>
<p>« Il est assez facile de séquencer des virus à partir de sédiments d&rsquo;eaux profondes … mais le défi est de reconnaître quels hôtes ces virus infectent », a déclaré Mart Krupovic, chef de l&rsquo;unité de virologie archéenne à l&rsquo;Institut Pasteur de Paris et co-auteur de l&rsquo;étude. autre <a rel="nofollow noopener" href="https://doi.org/10.1038/s41564-022-01122-y" target="_blank" data-url="https://doi.org/10.1038/s41564-022-01122-y"><u>deux</u><span class="sr-only"> (s&rsquo;ouvre dans un nouvel onglet)</span></a> <a rel="nofollow noopener" href="https://doi.org/10.1038/s41564-022-01144-6" target="_blank" data-url="https://doi.org/10.1038/s41564-022-01144-6"><u>études</u><span class="sr-only"> (s&rsquo;ouvre dans un nouvel onglet)</span></a>. « La correspondance d&rsquo;espaceurs CRISPR est l&rsquo;approche la plus pratique, la plus convaincante et la plus fiable pour attribuer l&rsquo;hôte. » </p>
<p>En fin de compte, l&rsquo;équipe de Rambo a découvert six virus qui infectent deux types d&rsquo;archées d&rsquo;Asgard, nommés Lokiarchaeota et Helarchaeota pour le dieu nordique Loki et la déesse Hel, respectivement. Les chercheurs ont nommé les nouveaux virus d&rsquo;après des créatures mythologiques nordiques, dont le loup géant Fenrir et le dragon Nidhogg.</p>
<figure class="van-image-figure inline-layout" data-bordeaux-image-check="">
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<p class="vanilla-image-block" style="padding-top:56.25%"><img alt="illustration de crispr-cas9 coupant un peu d'ADN d'un brin" class=" lazy-image-van" data-normal="https://vanilla.futurecdn.net/livescience/media/img/missing-image.svg" data-srcset="https://cdn.mos.cms.futurecdn.net/EzKHRH4bZJ5YDy45ein3U5-320-80.jpg 320w, https://cdn.mos.cms.futurecdn.net/EzKHRH4bZJ5YDy45ein3U5-480-80.jpg 480w, https://cdn.mos.cms.futurecdn.net/EzKHRH4bZJ5YDy45ein3U5-650-80.jpg 650w, https://cdn.mos.cms.futurecdn.net/EzKHRH4bZJ5YDy45ein3U5-970-80.jpg 970w" data-sizes="(min-width: 1000px) 970px, calc(100vw - 40px)" src="https://thebuzzly.com/wp-content/uploads/2022/07/De-nouveaux-virus-nommes-dapres-les-dieux-nordiques-auraient-pu.jpg" data-pin-media="https://thebuzzly.com/wp-content/uploads/2022/07/De-nouveaux-virus-nommes-dapres-les-dieux-nordiques-auraient-pu.jpg" /></p>
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</div><figcaption class=" inline-layout"><span class="caption-text">Une illustration du système CRISPR-Cas9 </span><span class="credit">(Crédit image : Shutterstock)</span></figcaption></figure>
<p>De même, dans une étude, Krupovic et ses collègues ont découvert deux virus qu&rsquo;ils ont nommés Huginn et Muninn, d&rsquo;après les deux corbeaux qui servent d&rsquo;éclaireurs au dieu nordique Odin ; ces virus ont été découverts dans un génome Asgard prélevé dans une source chaude du parc national de Yellowstone. </p>
<p>Dans l&rsquo;étude finale, Krupovic et ses coauteurs ont découvert des virus dans des sédiments d&rsquo;eau profonde collectés dans la péninsule de Shimokita, le cap nord-est de l&rsquo;île japonaise de Honshū, ainsi que deux autres sites dans le Pacifique et un dans l&rsquo;océan Indien. Dans ces échantillons, ils ont trouvé trois groupes de virus au niveau familial, qu&rsquo;ils ont nommés d&rsquo;après les trois Norns &#8211; Wyrd, Verdandi et Skuld &#8211; qui sont des êtres surnaturels qui déterminent les destinées des dieux et des mortels dans la mythologie nordique. </p>
<p><strong>Lié: </strong><strong>De la boue des profondeurs marines, une étrange goutte pourrait détenir des secrets sur les origines d&rsquo;une vie complexe</strong></p>
<p>En travaillant à partir de l&rsquo;ADN viral, les chercheurs ont pu déduire pour quels types de protéines les différents gènes codent et, par conséquent, à quoi les virus pourraient ressembler et fonctionner. </p>
<p>Par exemple, les virus nommés pour les Norn Verdandi ont probablement des queues qui s&rsquo;étendent de leurs coquilles externes, ou capsides, et les virus nommés pour Wyrd sont probablement en forme de citron, ont déterminé Krupovic et ses collègues. L&rsquo;équipe de Rambo a également trouvé des preuves que les virus Nidhogg pourraient être capables de détourner des protéines clés dans leurs cellules hôtes, ce qui aiderait les virus à produire de nouvelles copies d&rsquo;eux-mêmes. (Les virus qui infectent les cellules eucaryotes détournent leurs hôtes de la même manière.)</p>
<p>En fin de compte, les chercheurs n&rsquo;ont pu comprendre que les fonctions de certains des gènes des virus ; les fonctions de la grande majorité des gènes sont encore inconnues, a déclaré Erdmann. De plus, comme CRISPR ne fonctionne pas contre tous les virus, de nombreux autres virus infectant Asgard sont probablement encore à découvrir, a-t-elle déclaré. </p>
<p>Une façon de trouver ces virus cachés serait de cultiver des archées Asgard en laboratoire et d&rsquo;isoler tous les virus trouvés dans leurs cellules. « Cependant, la culture des archées d&rsquo;Asgard s&rsquo;est avérée très difficile », a noté Erdmann. À ce jour, un seul groupe de recherche a <u>archées d&rsquo;Asgard cultivées avec succès</u><span class="sr-only"> (s&rsquo;ouvre dans un nouvel onglet)</span>, et il leur a fallu 12 longues années pour le faire. C&rsquo;est en partie parce que les cellules archées mettent des semaines à se répliquer. (Par comparaison, la bactérie <em>Escherichia coli</em>par exemple, prend environ 20 minutes, <a rel="nofollow noopener" href="https://www.sciencenews.org/article/microbiologists-grow-microbe-tied-complex-life-origins" target="_blank" data-url="https://www.sciencenews.org/article/microbiologists-grow-microbe-tied-complex-life-origins"><u>selon Science News</u><span class="sr-only"> (s&rsquo;ouvre dans un nouvel onglet)</span></a>). </p>
<p>Jusqu&rsquo;à ce que davantage d&rsquo;Asgards puissent être cultivés en laboratoire, la correspondance d&rsquo;espaceurs CRISPR est probablement le moyen le plus efficace de trouver plus de virus, a déclaré Krupovic. Et à mesure que de plus en plus de virus sont découverts, leur rôle dans l&rsquo;émergence des eucaryotes &#8211; y compris les humains &#8211; peut devenir plus clair, a déclaré Rambo à Live Science.</p>
<p><em>Publié à l&rsquo;origine sur Live Science.</em></p>
</div>
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<br /><a href="https://www.livescience.com/asgard-viruses-origin-of-life/">Source link </a></p>

De nouveaux virus nommés d’après les dieux nordiques auraient pu alimenter l’essor d’une vie complexe
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1656823021 De Nouveaux Virus Nommes Dapres Les Dieux Nordiques Auraient Pu
- Categories: Science
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